Stage Analyse intégrée multi-omique des flux d’antibiorésistance dans les STEP corrélation des données chimiques, microbiologiques et génomiques

Le groupe Veolia a pour ambition de devenir l’entreprise de référence de la transformation écologique.

Présent sur les cinq continents avec près de 215 000 salariés en 2025, le Groupe conçoit et déploie des solutions utiles et concrètes pour la gestion de l’eau, des déchets et de l’énergie qui participent à changer radicalement la donne.

Au travers de ses trois activités complémentaires, Veolia contribue à développer l’accès aux ressources, à préserver les ressources disponibles et à les renouveler. En 2025, Veolia a servi 111 millions d’habitants en eau potable et 98 millions en assainissement, produit près de 42 tétrawattheures et valorisé 65 millions de tonnes de déchets. 

La Direction des Expertises Scientifiques et Technologiques (DEST) se situe au cœur de la stratégie de Veolia pour aider le Groupe à devenir l'entreprise de référence de la transformation écologique. Les expertises scientifiques et technologiques sont un des moteurs de l'évolution du Groupe. DEST a pour mission de répondre aux besoins des entités opérationnelles et de promouvoir l'excellence scientifique et technologique au sein du Groupe. 

Nous croisons les disciplines et les expertises pour contribuer au développement de solutions qui permettent de faciliter l’accès aux services essentiels et aux ressources naturelles, de préserver celles-ci et de les utiliser et de les recycler efficacement. Nous intégrons les propositions innovantes de nos partenaires scientifiques et techniques et les développons, nous expérimentons au plus près du terrain.

 

Le stage est à pourvoir au sein de l'équipe Monitoring et Caractérisation Biologique (MCB)

Titre du stage : Analyse du rôle des STEP dans les flux d'antibiorésistance à l'échelle des bassins versants

Dans le contexte marqué par l'urgence de lutter contre l'antibiorésistance (AR), de nouvelles exigences européennes imposent une surveillance des STEP >100 000 EH au regard de leur qualification comme points chauds de convergence des eaux usées chargées en bactéries résistantes, bactéries pathogènes et en résidus d'antibiotiques. Le/la stagiaire aura pour mission de développer une stratégie d'exploitation des données existantes (chimie, microbiologie, génomique) pour analyser le rôle des STEP dans les flux d'antibiorésistance à l'échelle des bassins versants et identifier les facteurs déterminants de cette propagation.. L'objectif est de compiler et structurer ces données hétérogènes, puis d'établir des corrélations entre les paramètres opérationnels et les données biologiques pour identifier les facteurs clés influençant les flux d'antibiorésistance. 

 

Missions principales : 

• Recherche bibliographique : Réaliser une revue de la littérature sur l'antibiorésistance dans les STEP et les bassins versants, la gestion des données (format, métrique en lien avec la réglementation européenne)

• Compilation et structuration des données : Collecter, organiser et harmoniser les données existantes (chimie, microbiologie, génomique) et leurs métadonnées associées

• Analyse de corrélations : Corréler les données de séquençage avec les analyses chimiques et microbiologiques pour identifier les relations entre paramètres et comprendre les mécanismes de transfert horizontal de gènes

• Valorisation des résultats : Développer des visualisations et synthèses permettant d'interpréter le rôle des STEP dans les flux d'antibiorésistance à l'échelle des bassins versants

 

Formation : Etudiant(e) en Bac+4/5 (Master 1 ou 2) en biotechnologie, Bioinformatique, Data Science, Data Management

Vos compétences :  

• Compétences en analyse de données et programmation (Python, R)

• Connaissances en microbiologie et/ou génomique appréciées

• Capacités d'analyse bibliographique et de synthèse

• Visualisation de données : Looker Studio, Tableau

• Familiarité avec les formats de données courants en biologie (fastq, pcrd, images, tables, texte, etc.)

Vos qualités, votre savoir-être :

Communication : Bonne expression orale et écrite en français

Culture sécurité, rigueur, capacité à travailler en équipe, dynamisme, bon esprit de synthèse, force de proposition / prise d’initiative, sens de l’organisation

 

 

 

 

Nos valeurs : 

Responsabilité, Respect, Solidarité, Innovation, Sens du client

Environnement de travail:

• Environnement stimulant

• team buildings, créativité, innovation

• croisement des expertises et des disciplines

• des sujets de travail renouvelés pour découvrir et grandir

• une vision large des enjeux et des activités de Veolia pour ressourcer le monde

• un accompagnement pour se développer professionnellement

• les opportunités d’évolution au sein d’un groupe mondial

 

En tant qu'entreprise inclusive, Veolia s’engage pour la diversité et accorde la même considération à toutes les candidatures, sans discrimination. 

Pour postuler merci de joindre dans l'onglet “pièces jointes” CV et lettre de motivation en format PDF (nommés de la manière suivante : Nom Prénom_CV et Nom Prénom_LM)

 

En tant qu'entreprise inclusive, Veolia s’engage pour la diversité et accorde la même considération à toutes les candidatures, sans discrimination.